Mega-CD inclus : le vrai argument de cette suite
La grande nouveauté de la Mini 2 est l'intégration de jeux Mega-CD, l'extension à lecteur de disques sortie au début des années 1990. Pour la première fois, des titres comme Sonic CD, Night Trap, Silpheed, Shining Force CD ou Ecco the Dolphin dans sa version CD sont accessibles sur une mini-console officielle, sans le matériel d'origine, rare et fragile.
Le catalogue Mega Drive est également riche, avec des titres moins évidents que ceux de la première Mini, comme Alien Soldier, After Burner II ou Virtua Racing. Sega a ajouté sept jeux qui n'étaient jamais sortis sur Mega Drive, entre titres inédits et nouvelles conversions de jeux d'arcade : c'est une signature des Mini de Sega, déjà présente sur le premier modèle avec Darius et Tetris.
Les versions japonaise et nord-américaine n'ont pas exactement la même liste, avec 61 jeux au Japon et 60 en Amérique du Nord. Une option permet aussi de reproduire le son de la première Mega Drive ou celui de la Mega Drive 2, un détail apprécié des puristes.
Ce choix de catalogue donne à la Mini 2 une identité différente de la première Mini. Là où celle-ci réunissait les incontournables, Sonic the Hedgehog, Streets of Rage 2 ou Gunstar Heroes, la suite explore davantage les titres de niche, les shoot'em up et les expériences en vidéo plein écran propres au Mega-CD. Elle s'adresse donc à un public qui connaît déjà les grands classiques de la marque et cherche à aller plus loin.